我院管珊珊副教授研究团队在肺炎链球菌神经氨酸酶的抑制剂研究方面取得了新进展。
相关研究成果以“ Exploration of Binding Mechanism of a Potential Streptococcus pneumoniae Neuraminidase Inhibitor from Herbaceous Plants by Molecular Simulation ”为题,于2020年2月3日发表于国际期刊International Journal of Molecular Sciences。
肺炎链球菌可导致肺炎、中耳炎、脑膜炎和败血症等疾病,严重威胁人类健康。神经氨酸酶作为肺炎链球菌的关键毒力因子,已被视为具有潜力的药物设计靶点之一。很多草本植物中的活性物质具有抗病毒和抗菌能力,绿原酸是其中一种。绿原酸是一种多酚类物质,可存在于牛蒡、杜仲、金银花、苦蒿等草本植物中,研究表明其对流感病毒和肺炎链球菌具有抑制潜力。本研究应用模拟计算方法探究了绿原酸与肺炎链球菌神经氨酸酶的潜在作用机制。本研究利用分子对接方法获得了绿原酸-神经氨酸酶复合物体系,并利用分子动力学模拟和结合自由能计算等方法获得了绿原酸在酶活中心的动态结合行为和结合潜力。研究表明绿原酸可稳定结合在肺炎链球菌神经氨酸酶的活性中心,并与神经氨酸酶活性中心的Arg347, Ile348, Lys440, Asp372, Asp417和Glu768等氨基酸残基以氢键、盐键及cation-π 等微观作用力结合。酶活中心的Arg347侧链可能形成cap-like结构以稳定绿原酸的结合。本研究从微观层面揭示了绿原酸-神经氨酸酶复合物体系的结合模式,研究结果可为将来以该酶为靶点的抑制类药物设计提供理论线索。
论文第一单位为吉林工程技术师范学院,第一作者、通讯作者为管珊珊副教授。论文的发表标志着食品工程学院在生物计算领域的新拓展。