学院围绕国家和吉林省农产品加工发展规划和重大技术需求开展教学科研工作，形成了食品科学与工程、食品营养与检验教育、食品质量与安全、生物工程4个稳定方向。在葡萄酒酿造工艺、杂粮等粮食精深加工与营养健康食品及副产物高值化利用、长白山特色植物高效利用与功能性食品开发、农畜产品加工与质量安全控制及评价等方面形成鲜明特色及优势：凝练了生物检测技术研究中心、食品安全检测与控制、分子营养、山葡萄资源开发、长白山特色食物资源贮藏与加工、生物材料的开发与利用、食品营养成分的功能研究与应用、杂粮资源开发8个科研创新团队。

“十三五”期间，参与国家重点研发计划、吉林省重大科技攻关项目等国家和省部级重大、重点项目项，纵向科研项目189项，横向科研项目53项，经费累计达800万元，实现国家自然科学基金项目零的突破，获国家自然科学基金青年基金1项；科研成果获奖26项，其中省部级科技进步三等3项。授权知识产权共176件，其中发明专利5件；发表论文368篇，SCI收录68篇，其中二区以上文章11篇，EI收录5篇。培训包括农民、技术工人及工艺师等各类人员5000多人次。与吉林省库美生物科技有限公司、吉林省叁宝科技有限公司、长春市朱老六食品股份有限公司和山青岛尚医制药有限公司等5家企业建立了校企合作。